柯南和小五郎等拉着大队，来到位于太平洋中的美丽小岛“神海岛”渡假。这座岛屿自古已有流传，大概有关沉没于海底的古代遗迹“海底宫殿”，及300年前两名女海盗遗留下来的宝藏传说。小兰和园子不惧流传，在“海底宫殿”附近潜水时，意外遇到一大群正在寻找宝物的猎人，不料其中一人突然遭鲨鱼攻击，不幸身亡！小兰和园子幸运逃难，柯南见那位猎人死状诡异，与灰原一起展开调查。 柯南认为猎人之死，跟宝藏传说有着莫大关系，他试图解开背后原因，“海底宫殿”的谜题一直系绕在他的脑海中。他找到了一组神秘名词“Jolly Roger(海盗旗)”后，满以为有所起色，猎人却突然现身，并偷走了原来发现的宝藏！小兰和园子落在猎人的魔掌之中，性命危在旦夕！隐藏于传说中的讯息是什么？“海底宫殿”有什么秘密？穿越300年时光的暗号，柯南誓要逐步解开迷题
何热·卡尔 洛兰特·道驰 莎拉·弗里斯蒂 雅克·弗朗茨 皮埃尔·帕尔马德 皮埃尔·切尔尼亚 伯纳德·阿兰 Marc Alfos Jules Azem Patrick Borg 菲利普·卡图瓦尔 Bruno Dubernat 吕克·弗洛里昂 Stéphane Fourreau 玛丽昂·加姆 文森特·格拉斯 梅德·翁多 罗兰·坦西 芭芭拉·蒂西耶 Vania Vilers 布丽奇特·维图德斯 西恩·奥斯汀 布拉德·加内特 保罗·吉亚玛提 埃文·蕾切尔·伍德 戴德里克·巴德 迪·布拉雷·贝克尔 杰夫·贝内特 科
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